Arkivet innehåller material i form av manuskript till uppsatser, avhandling och föreläsningar. Här återfinns även korrespondens och material kring projekt där Ekstedt varit engagerad. Bland arkivmaterialet finns även handlingar kring jubiléer, musikforskning och diverse musikevenemang
Den moderna kinematografen, Studentuppsats 1948-1949 Kirurgiska behandlingsmetoder, Studentuppsats 1949-1950 Human single muscle fiber action potentials, Manuskript till avhandling. 1964 Tal till utexaminerade läkare 1990 Den musikaliska hjärnan, manuskript till samtal mellan Ekstedt och Nils Wallin på KVA 1993 Neurologi. Ett försök till systematik. Föreläsningar för neurologistudenter 1995 Jan Ekstedts avskedsföreläsning, overheadmaterial 1996 CREDO 2000, tankar inför 2000-talet, ljudupptagning 1999 Music and Manipulation, öppningstal vid konferens 1999 Musikens neurobiologi, manuskript till samtal mellan Ekstedt och Nils Wallin på Festival och Forum 21, Nalen 2000 Biomusikvetenskap- vad vet man om musiken och hjärnan? Manuskript till samtal mellan Ekstedt och Nils Wallin 2001 The Early Struggles with Single Fiber Electromyography, manuskript (även konferenshandlingar till “The Erik Stålberg symposium” 2001) 2001 Neurologi och arkiv, manuskript till Scriptum 52 2003 Det var så det började. Om Björkgårdens historia. Tal vid Björkgårdens 25-års jubileum 2005
Butajira Neuro projektet (Etiopien): Ansökningar och planering 1983-1998 Handlingar kring professor Redda Tekle Haimanot 1983-1997 Dagboksnoteringar, film och reseberättelser 1982-1998 Fotografier och ritningar kring behandlingshemmet 1991-1996 Grarbet Ledecuman (GBL) Rapporter och särtryck GBL 1990-2003 Tidningsklipp kring GBL 1984-1996 GBL efter 1996 1996-2003
Övrigt Fotografier av personal vid forskningslaboratoriet på Neurologen i Umeå 1996 Återsamling av 1951 års medicine studerande vid Medicinska Högskolan i Göteborg - brev och program 1999 Artiklar om Sven Stolpe och Gustaf Lundström u.å, 1992
Lyckönskningar till Jan Ekstedts disputation 1964 Algot Mångbergs guldmedalj (testamente) 1979 Gratulationsvers från personalen på neurologkliniken 1981 Curriculum Vitae 1998
Sammanställning över Jan Ekstedts publicerade arbeten 1963-1997 Sammanställning över Jan Ekstedts opublicerade manuskript 1958-1977 Tryck och särtryck av Ekstedts publikationer kring Single Fiber Electromyograhy (SFEMG) 1964-1975 Filosofiska spekulationer rörande neurologi, svensk och engelsk version (särtryck) 1996-1997 Särtryck av Ekstedts övriga publicerade arbeten (ej komplett) 1965-2002
Biomusikvetenskap: Planering för forskarskola i biomusikvetenskap vid Mitthögskolan i Östersund, planer, ansökningar, klipp 1994-1998 Biomusikvetenskap - uppsatser, konferenser 1994-2000 Internationella musikfestivalen i Järna 1998 Förslag till att utnämna Nils Wallin till professor 1996-1999 Minnesord över Nils Wallin 2002
